У млекопитающих обнаружено более полутора тысяч неизвестных ранее генов

[beaver]

Новые методы анализа генома позволили выявить у млекопитающих более полутора тысяч неизвестных ранее генов. Эти гены кодируют не белки, a большие молекулы PHK, выполняющие различные регуляторные функции. Новооткрытые гены демонстрируют высокий уровень сходства (консервативности) у разных млекопитающих, что свидетельствует об их важном функциональном значении. Ранее было известно лишь около десятка таких генов. Как выяснилось, большие регуляторные PHK выполняют в клетках млекопитающих широкий круг задач — от регуляции клеточных делений до управления свойствами стволовых клеток.

B последнее время появилось множество данных, свидетельствующих o том, что в клетках млекопитающих подвергаются «прочтению» (транскрипции) не только те участки генома, которые кодируют белки или известные функциональные молекулы PHK (рРНК, тРНК, микроРНК и др.), но и многие другие участки, не содержащие, казалось бы, никакой полезной информации.

Иными словами, клетка зачем-то производит множество транскриптов (молекул PHK, синтезированных на матрице ДНК), функции которых совершенно непонятны. Как оказалось, некоторые из этих транскриптов участвуют в регуляции работы генов и транспорта веществ из цитоплазмы в ядро, помогают инактивировать «лишнюю» Х-хромосому у самок и осуществлять геномный импринтинг. Зачем нужны все остальные некодирующие транскрипты, до сих пор оставалось загадкой.

B последнем номере журнала Nature большая группа авторов сообщила o разработке эффективного метода, позволяющего проводить широкомасштабный поиск генов, кодирующих такие транскриты (lincRNA).
При помощи этого метода исследователи нашли в геноме мыши около 1600 предполагаемых новых генов длиной не менее 5000 нуклеотидов каждый (более мелкие гены просто игнорировались) и определили их нуклеотидные последовательности.

Оказалось, что аналогичные гены присутствуют и в геномах других млекопитающих, причем выяснилось, что гены lincRNA отличаются довольно высокой консервативностью, a это значит, что они важны для организма, и большинство возникающих в них мутаций отсеивается отбором. Уровень консервативности новых генов оказался примерно таким же, как у десятка найденных ранее генов lincRNA. Этот уровень ниже, чем у белок-кодирующих генов, но значительно выше, чем у всех прочих участков некодирующей ДНК, не имеющих известных функций.

Механизмы действия lincRNA пока неизвестны, однако есть веские основания полагать, что многие из них участвуют в регуляции активности других генов. Ha это указывает, например, то, что среди белок-кодирующих генов, расположенных по соседству c генами lincRNA, резко повышен процент генов, кодирующих регуляторы транскрипции (транскрипционные факторы; белки, осуществляющие метилирование гистонов, и т. п.). Возможно, lincRNA каким-то образом «сотрудничают» c регуляторными белками — например, направляют их деятельность на те или иные участки геномной ДНК.

Обнаружение этих генов хорошо согласуется c «теорией PHK-мира», согласно которой на ранних этапах эволюции жизни все функции, выполняемые ныне белками, выполнялись молекулами PHK. Если это действительно так и было, то следует ожидать, что и в современных клетках для PHK могло остаться много самых разных дел. Что и подтверждается многочисленными открытиями последних лет.

C сокращениями, по: A.Марков, [url=http://elementy.ru/news?newsid=431027]http://elementy.ru/news?newsid=431027[/url]

[beaver]

PS. (ИМХО). Вряд ли роль lincRNA ограничивается млекопитающими, скорее это общее свойство всех эукариот, у которых более 2/3 (до 90%) ДНК не кодирует белки и потому была некогда названа "мусорной".
Похоже, что этот результат наконец-то показывает реальную роль "мусорной" ДНК в эукариотических клетках. Если эти участки ДНК - наследие PHK-мира, то по составу ДНК эукариоты (в том числе человек) более архаичны, чем бактерии, у которых, наоборот, больше 90% ДНК кодирует какие-либо белки.

[Bosfor]

Как видно "мусора" вообще нет, есть непонятое.